Multe procese biologice sunt create—sau pot fi simulate—de automați celulari. Exemple ar fi următoarele:

​

   1. Tiparele unor scoici, precum cele din genurile Conus și Cymbiola sunt generate de automate celulare naturale. Celulele pigmentare se află într-o bandă îngustă de-a lungul buzei cochiliei. Fiecare celulă secretă pigmenți în funcție de activitatea de activare și inhibare a celulelor sale pigmentare vecine, respectând o versiune naturală a unei reguli matematice.

​

​

​

​

​

​

​

 

   2. Plantele își regulează admisia și emisia de gaze cu ajutorul unui mecanism bazat pe un automat celular. Fiecare stomată din frunză se comportă ca o celulă din matrice.

​

   3. Regula 30 a fost folosită în criptografie, iar automate celulare cu două dimensiuni pot fi folosite pentru a crea un generator de numere pseudo-aleatoare